Kuntoutustutkimuksen tavoitteena on yhdessä kuntoutujan kanssa selvittää hänen fyysistä ja psyykkistä terveydentilaansa sekä sosiaalista elämäntilannettaan suhteessa työelämän vaatimuksiin. Kuntoutustutkimuksessa laaditaan ammatillinen kuntoutussuunnitelman kuntoutusvaihtoehtoineen.
Tutkimuksen sisältö määräytyy sopimuskohtaisesti ja sen kesto vaihtelee lähettävästä tahosta sekä tarvittavista selvityksistä riippuen. Kesto on 5-15 vrk ja tutkimus voidaan toteuttaa jaksotetusti.
Perustyöryhmään kuuluvat aina lääkäri, sosiaalityöntekijä ja psykologi sekä useimmiten myös ammatillisen kuntoutuksen ohjaaja. Tarvittaessa työryhmään voi kuulua myös muita erityistyöntekijöitä.